顯微鏡攝像頭也叫顯微鏡相機，是專門用于和顯微鏡結合來獲取顯微鏡成像圖像的光學儀器。按照所使用的圖像傳感器來分顯微鏡攝像頭可分為CCD攝像頭和CMOS攝像頭(數(shù)字攝像頭和模擬攝像頭)2種。顯微鏡攝像頭是一種專門針對微觀世界領域的成像儀器，和數(shù)碼相機等使用的攝像頭有很大的區(qū)別。同時顯微鏡攝像頭也可以通過和PC鏈接，或結合專業(yè)的圖像處理軟件將顯微鏡觀察到的樣本微觀圖像輸送出來，這非常有利于研究人員的對樣本的研究。
 

　　顯微鏡攝像頭采集到的圖像數(shù)據(jù)需要在成像設備(通常是計算機)中進行顯示。計算機本身是無法進行顯微視頻的顯示和預覽的。完整的顯微鏡成像系統(tǒng)還需要專業(yè)的顯微鏡成像軟件來顯示和管理攝像頭傳輸來的數(shù)據(jù)。
 

　　顯微鏡成像軟件的功能包括數(shù)據(jù)解碼，實時預覽，攝像頭參數(shù)調節(jié)，圖像處理，圖像保存等基本功能。針對不同應用領域，成像軟件還需要其他的高級功能。在金相分析上，就需要成像軟件有測量、顆粒分析、紋理分析以及完整的報表輸出等功能。在血液，精液分析中，又需要形態(tài)學分析、自動計數(shù)等功能。對于觀測大景深的物體需要景深擴展功能，較大的物體又需要圖像拼接功能。弱光，熒光環(huán)境，又需要成像軟件有偽彩增強和熒光分析等功能。
 

　　顯微鏡成像軟件的好壞往往會影響到整個系統(tǒng)的成像效果。因為在選擇顯微鏡成像軟件時，需要根據(jù)不同的領域，不同的使用環(huán)境，選擇合適的軟件來配合攝像頭的使用。